MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome II

Total Repeats: 1336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006397	CTG	3	9	40	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006397	TAGA	2	8	62	69	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006397	ACA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006397	CGA	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006397	CAA	2	6	149	154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006397	GA	3	6	320	325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006397	TC	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006397	TGG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006397	TGG	2	6	417	422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006397	GCC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_006397	CGA	2	6	579	584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006397	TCG	2	6	591	596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006397	ATGA	2	8	617	624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006397	CGG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006397	GTGGC	2	10	777	786	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006397	CT	3	6	800	805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006397	AAC	2	6	808	813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_006397	CCA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_006397	AC	3	6	881	886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006397	AGC	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006397	ACG	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006397	AAC	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006397	GAC	2	6	1048	1053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006397	TCA	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006397	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006397	GC	3	6	1227	1232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006397	TCC	3	9	1286	1294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_006397	GTA	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006397	CCTA	2	8	1378	1385	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_006397	TGC	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006397	TAC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006397	CCG	2	6	1596	1601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_006397	TGT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006397	CTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006397	GTTG	2	8	1806	1813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006397	CGC	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_006397	CCG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_006397	CAG	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006397	GCT	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_006397	TCCA	2	8	2227	2234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006397	GGT	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006397	GCT	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006397	ACC	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_006397	GTT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006397	CCT	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006397	CTC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_006397	AC	3	6	2570	2575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006397	CGG	2	6	2606	2611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006397	CGG	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006397	AC	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006397	CG	3	6	2965	2970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006397	CGTT	2	8	3065	3072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_006397	ACT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006397	TCG	2	6	3239	3244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006397	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006397	TCC	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006397	AG	3	6	3417	3422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006397	TTC	2	6	3445	3450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006397	TCA	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006397	CCA	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006397	TAG	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006397	CGT	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006397	AC	3	6	3597	3602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006397	TGG	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006397	GTC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006397	AGT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006397	CAGT	2	8	3873	3880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006397	GTT	2	6	3889	3894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006397	CAA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006397	AGG	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006397	GT	3	6	4075	4080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006397	CG	3	6	4104	4109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006397	TAC	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006397	GCGG	2	8	4146	4153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006397	ACTACG	2	12	4173	4184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006397	TTCC	2	8	4289	4296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006397	TCC	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006397	ACC	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_006397	CGG	2	6	4418	4423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006397	CCT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006397	GTC	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006397	TAC	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006397	CTC	2	6	4530	4535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006397	GGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006397	TC	3	6	4739	4744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006397	TGG	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006397	TC	3	6	4817	4822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_006397	AAT	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006397	CGG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006397	ACC	2	6	4995	5000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_006397	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006397	TGG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006397	CCA	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006397	CT	3	6	5239	5244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006397	GCG	2	6	5437	5442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006397	ACT	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006397	CGG	2	6	5539	5544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006397	ACACGA	2	12	5567	5578	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006397	ACCCA	2	10	5610	5619	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_006397	TGC	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006397	GGGAG	2	10	5688	5697	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006397	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006397	AC	3	6	5759	5764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_006397	GGT	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006397	AGT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006397	GGA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006397	AAAT	2	8	5904	5911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006397	CGA	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006397	TGC	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006397	CGT	2	6	6018	6023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006397	CGG	2	6	6063	6068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006397	CG	3	6	6130	6135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006397	TG	3	6	6136	6141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006397	ACG	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006397	ACG	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006397	TTC	2	6	6489	6494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006397	TCT	2	6	6511	6516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006397	G	6	6	6607	6612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006397	GCT	2	6	6659	6664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006397	GGT	2	6	6705	6710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006397	TGGT	2	8	6770	6777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006397	GTG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006397	TG	3	6	6811	6816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006397	TGAG	2	8	8077	8084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006397	GTT	2	6	8097	8102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006397	ACC	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006397	AT	3	6	8156	8161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006397	GGA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006397	TA	3	6	8240	8245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006397	TA	3	6	8300	8305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006397	G	6	6	8315	8320	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006397	AC	3	6	8326	8331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006397	ATT	2	6	8509	8514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006397	C	6	6	8525	8530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_006397	AAC	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006397	CGA	2	6	8560	8565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006397	TAA	2	6	8602	8607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006397	GTA	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006397	GTT	2	6	8645	8650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006397	GAAA	2	8	8669	8676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006397	CTA	2	6	8704	8709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_006397	G	6	6	8727	8732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006397	CTT	2	6	8749	8754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_006397	TAG	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006397	CTT	2	6	8853	8858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006397	AT	3	6	8925	8930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006397	CTC	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_006397	AGTT	2	8	8999	9006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006397	GAA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006397	T	6	6	9068	9073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006397	TCCAA	2	10	9310	9319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_006397	GAAC	2	8	9320	9327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_006397	CT	3	6	9479	9484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_006397	CTG	2	6	9568	9573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_006397	CAA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_006397	TC	3	6	10117	10122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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164	NC_006397	AG	3	6	10131	10136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_006397	TA	3	6	10137	10142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_006397	TTA	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_006397	CAA	2	6	10296	10301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_006397	A	6	6	11256	11261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_006397	GTT	2	6	11314	11319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_006397	GA	3	6	11348	11353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_006397	CTGGC	2	10	11379	11388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_006397	TGGGA	2	10	11777	11786	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
176	NC_006397	TTG	2	6	11791	11796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_006397	TGT	2	6	12017	12022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_006397	TGT	2	6	12150	12155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_006397	CTA	2	6	12164	12169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_006397	GC	3	6	12224	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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188	NC_006397	GCAA	2	8	14450	14457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_006397	CCT	2	6	14473	14478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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284	NC_006397	GAC	2	6	25323	25328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_006397	AAT	2	6	25338	25343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_006397	CACGA	2	10	25372	25381	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_006397	TGGT	2	8	25398	25405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
288	NC_006397	GGA	2	6	25415	25420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_006397	GTCA	2	8	25436	25443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_006397	GAG	2	6	25484	25489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_006397	ATT	2	6	25510	25515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_006397	GACA	2	8	60785	60792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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